Ook voor de dieselaars zijn er verschillende keuzemogelijkheden: de basisdiesel (2.0 TDI 163 pk, 6 versnellingen) kost minimaal 39.870 euro, evenveel als de benzine-instapversie dus. Voor 45.070 euro heb je de 3.0 TDI met 204 pk en zesversnellingsbak. Ook hier weer een Multitronic tegen een meerprijs van 2.300 euro op beide motorisaties. De 3.0 TDI 204 pk met S-Tronic kost 50.620 euro, voor dezelfde versnellingsbak en motorisatie in 245 pk versie betaal je 54.270 euro.

Daarmee kost de A6 Avant zowat 2.170 euro meer dan de berlineversie. Uiteraard krijg je daar een hele hoop moduleerbare bagageruimte (565 - 1.680 liter) voor terug.

De 2.8l benzinemotor en 3.0 TDI in 204pk-versie krijgen Quattro-aandrijving als optie. Quattro komt standaard bij de 3.0 TFSI & 3.0 TDI. De S-line versie van bovenstaande wagens kost je minimaal 5.040 euro extra (afhankelijk van de motorisatie) en dat bedrag kan je nog aandikken door de lange optielijst te doorlopen.

Op termijn voorziet Audi nog een dikkere 3.0 TDI met dubbele turbo en 313 pk. Ook een hybride versie staat op de planning.